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T2BGE2803 - Microbiologie de l’Environnement (E. Dugeny)

Course categorySciences de l'Environnement et Ecotechnologies (SEE)

Les écosystèmes inféodés aux sols rassemblent une grande diversité d'organismes. Parmi ces êtres-vivants, un très grand nombre de microorganismes y vivent et s'y développent grâce au substrat conféré par les différents types de sols. En retour, l'écosystème sol a besoin des microorganismes pour maintenir ses propriétés. La diversité des organismes dans le sol est bien plus importante que celle que nous pouvons retrouver dans le corps humain, par exemple.Dans ce TP, nous nous intéresseront à évaluer les propriété d'échantillons de sols prélevés, en caractérisant une série d'indicateurs chimiques, physiques et surtout, biologiques. Nous évaluerons certaines propriétés mesurables et nous ensemenceront sur des milieux bien spécifiques, les différents prélèvements pour déterminer les types de microorganismes se développant dans ces types de sols. Le TP est réparti sur trois séances de deux heures:- Jour 1: Prélèvement de sol, traitement pour mesures d'indicateurs physico-chimiques et préparation des milieux de cultures - Jour 2: Préparation des suspensions et dilutions à partir d'échantillons de sol et étalement sur milieux de cultures- Jour 3: Dénombrement des microorganismes, observation macroscopique et microscopique des colonies, puis analyse des donnés de nitrate et calcul de potentiel de nitrification. Un compte-rendu est attendu par groupe de travail.L'objectif de ce TP est de comprendre comment peut se faire l'évaluation d'un sol pour l'utilisation agricole. Pour nos séances, nous nous attèlerons à décrire le sol en proximité au bâtiment F et l’échantillonnage se fera dans les 20 cm supérieurs. Des réplicats pourront nous aider à comprendre l’homogénéité de la présence de certains types de sol dans la région. Nous ne traiterons pas dans ce TP des règlementations utilisés pour le suivi de qualité de sol de façon générale, mais sachez que les organismes gouvernementaux sont préoccupés à observer le changement des sols selon le climat et l’utilisation du sol.

Enseignant: DUGENY Elyne
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