Bienvenue sur la plateforme pédagogique de l'Université de Toulon

Le Quorum Sensing’ (QS) est un  processus de communication entre les micro-organismes. Le QS est impliqué dans de nombreux processus physiologiques incluant la formation et le développement du biofilm, la résistance aux antibactériens, la bioluminescence ainsi que la virulence chez les bactéries. Ce cours vise à développer les aptitudes à la lecture critique de la littérature scientifique ainsi que l’analyse et l’interprétation de résultats expérimentaux. La séance de cours se déroule sous forme de discussion d’articles scientifiques sur le QS proposés par l’enseignant. Tous les étudiants seront sollicités.  Durant la séance de travaux dirigés (TD), chaque étudiant va faire une présentation de 5min portant sur la critique d’un article scientifique (choisi par l’étudiant) sur le sujet. L’ordre de passage suivra l’ordre alphabétique. Les étudiants seront noté sur leur participation au cours et leur présentation.

L’objectif est d’analyser différents jeux de données (SST, station marégraphe, traces SLA, …) géophysiques à l’aide de Python. Les codes développés pendant les TP permettront de lire les données (souvent en format netcdf), les visualiser, et en faire un traitement statistique (moyenne, analyse en composantes principales, FFT, filtrage, …) pour en extraire des interprétations physiques.

 Introduction aux fondamentaux de la résolution par méthodes numériques (différences finies) des équations aux dérivés partielles (EDP) utilisées en géophysique. Pratique et approfondissement de la programmation scientifique (MATLAB®). Capacité à définir, réaliser et analyser une expérience scientifique basée sur la modélisation numérique d’un écoulement géophysique

• Introduction aux fondamentaux de la résolution par méthodes numériques (différences finies) des équations aux dérivés partielles (EDP) utilisées en géophysique. 
• Pratique et approfondissement de la programmation scientifique (MATLAB®). 
• Capacité à définir, réaliser et analyser une expérience scientifique basée sur la modélisation numérique d’un écoulement géophysique

Contenu synthétique du cours - Rappels d’océanographie physique - Analyse des forces / équations du mouvement - Solution théorique (Ekman) et résolution des équations de Navier-Stokes - Ondes océaniques - Courant générés par le vent en zone côtière - Les marées

Mise à niveau sur la dynamique des fluides géophysiques newtoniens (Océan et Atmosphère): équations de conservation de la matière, de la quantité de mouvement et de l’énergie; formalisme mathématique et cinématique des fluides; Vorticité et géostrophie; viscosité, turbulence et notion de couche limite; circulation grande échelle due aux vents..

.

Ce cours vise à mieux définir la problématique des plastiques, et en particulier des microplastiques, dans l'environnement marin. Pour avoir une vision la plus globale possible, les intervenants sont de disciplines différentes mais complémentaires: chimie des matériaux, modélisation physique, géochimiste et microbiologiste.

L'objectif est de mettre à disposition des informations générales pour les M2 du master SDM (stages, evaluations...)

 TD SIG Systèmes d'Informations Géographiques

 M2/Seatech 3A

Intervention d'intervenants extérieurs sur les parcours professionnels, expériences professionnelles et présentation de métiers en lien avec la formation.

Présentation bibliographique en anglais.

Information sur les stages et dépôt de Rapport

Chimie analytique: présentation de méthodes de mesure voltamétriques pour l'analyse des métaux dans des matrices complexes

.

CSM351-modélisation géochimique entre les phases dissoutes et solides par le code PHREEQC

 CSM332-Radiochimie appliquée à l'environnement 

Modélisation des spéciations chimiques en solutions - Optimisation de constante.

Donner aux étudiants les compétences nécessaires pour appréhender les particularités et l’importance globale des zones côtières.

Les mécanismes de transfert à l'échelle du globe: libération de matière par continents, transport dissous ou figuré, mécanismes du transport (hydraulique et éolien), transferts marges-abysses, transfert et spéciation, contrôles biologiques.

Les cycles biogéochimiques et leur diversité. Cycle du carbone, de l'azote, du silicium.

 Ce cours a pour but de mieux appréhender le rôle des molécules naturelles dans les interactions entre organismes marins. Ce cours sera divisé en 5 parties : Introduction à l'écologie chimique marine par Thierry Pérez (IMBE, Aix-Marseille Université), Substances naturelles marines par Gérald CULIOLI (IMBE, Avignon Université), Ecologie chimique marine (bases) par Annick Ortalo-Magné (MAPIEM, Université de Toulon) Communication bactérienne par Elisabeth Kay (CIRI, Université de Lyon 1), Communication entre micro- et macro-organismes par Jean-François Briand (MAPIEM, Université de Toulon

Support du cours sur les Perturbateurs endocriniens.

1. Analyse fréquentielle

• (a) Transformée de Fourier. Définition. Propriétés. Invariances. Formule d’inversion.Conservation de l’énergie. Formule de Parseval. Exemples.
• (b) Notion de résolution temporelle et fréquentielle. Principe d’incertitude. Cas optimauxet cas extrêmes.
• (c) Liens entre la décroissance HF et la régularité du signal.
• d) Signal analytique.
• (e) Première approche du temps-fréquence: notion de fréquence instantanée.
• (f) TP1: Rappels sur l’échantillonnage des signaux. Implémentation numérique en Mat-lab de la TF et illustrations de ses propriétés sur certains signaux typiques.

2. La Transformée de Fourier à Court Terme

• (a) Origine, définition et propriétés.
• (b) Représentation temps-fréquence. Spectrogramme. Exemples.
• (c) Influence de la fenêtre. Compromis temps-fréquence.
• (d) Formule d’inversion.
• (e) Noyaux reproduisants
• .(f) Propriétés du spectrogramme: énergie, marginales, inversion.
• (g) Fréquence instantanée et spectrogramme.
• (h) TP2: Implémentation numérique en Matlab de la TFCT et illustrations de ses propriétés sur certains signaux typiques.

3. La Transformée en Ondelettes

• (a) Fenêtres de Gabor et ondelettes.
• (b) Définition de la TO continue. Représentation temps-échelle. Scalogamme. Exemples.
• (c) Applications à la détection et caractérisation de singularités.
• (d) Propriétés du scalogramme. Energie. Marginales.
• (e) Formule d’inversion.
• (f) TP3: Implémentation numérique en Matlab de la TO et illustrations de ses propriétés sur certains signaux typiqu0

Quelles sont les mécanismes derrières les phénomènes météorologiques de la méso-échelle ? Introduction ...